網站的目標及內容主題等有關問題已經確定。結構設計要做的事情就是將內容劃分為清晰合理的層次體系，如欄目的劃分及其關系、網頁的層次及其關系、鏈接的路徑設置、功能在網頁上的分配等。
網站物理結構是指網站目錄及其包含文件的真實存儲位置所表現(xiàn)出來的結構，一般有兩種表現(xiàn)形式，分別是扁平式物理結構和樹形物理結構。網站的目錄是建立網站時所創(chuàng)建的目錄，目錄結構則主要是指物理結構和邏輯結構。當網站涉及多個尤其是成千上萬個頁面時，就需要有一個清晰的網站結構來確保搜索引擎的抓取和用戶的訪問。網站的目錄結構就起到這樣的作用，它在SEO中意義非凡。
千萬不要把一個網站的所有文件都放在根目錄下，這會給網站造成非常大的負擔，降低文件上傳的速度，維護起來也會非常麻煩。每個子目錄都應該有自己的文件從屬，如image、extension。不管是數據庫后臺還是網站自動生成的頁面，都需要遵循這個目錄結構，這樣做的好處是不會造成網站文件的混亂。
與網站的物理結構不同，網站的邏輯結構也稱鏈接結構，主要是指由網頁內部鏈接形成的邏輯結構。邏輯結構和物理結構的區(qū)別在于，邏輯結構由網站頁面的連接關系決定，而物理結構由網站頁面的物理存儲位置決定。在網站的邏輯結構中，通常采用“鏈接深度”來描述頁面之間的邏輯關系。鏈接深度是指從源頁面到達目標頁面所經過路徑的數量。
了解鏈接結構之前，我們需要熟悉一個概念——拓撲結構。所謂拓撲結構是指網絡中各個站點相互連接的形式，它反映的是一個網站中實體和實體之間的鏈接形式，而網站中的拓撲就是頁面與頁面之間的結構關系，如圖1-10所示。
層疊樣式表，也就是CSS，是一種用于控制網頁樣式并允許將樣式信息與網頁內容分離的標記性語言，目前流行的是DIV+CSS布局方式。CSS能夠幫助我們實現(xiàn)許多功能，對普通站長來說，CSS顯得過于復雜，這里我們只需要了解它的作用就可以了。對CSS感興趣的讀者可以自己學習一下，這對于站點布局是有好處的。
相較于CSS，表格布局相對簡單，表格在格式化文本時非常便捷。但是，CSS要更為穩(wěn)定一些，可是頁面中如果出現(xiàn)多表格嵌套的話，會增加頁面負擔，不僅用戶體驗不好，而且對搜索引擎也不友好（因為大量的表格框架代碼不利于搜索引擎的檢索和收錄）?？蚣芷鋵嵤且环N很好的布局方式，但是它有一個缺點，就是不利于進行SEO推廣，搜索引擎也不是很喜歡它。